一、 POS机所属单位区别。银联POS机是中国银联股份有限公司的下属企业中国银联商务有限公司的产品。中国银联股份有限公司是国务院和中国人民银行等机构批准成立的国内银行卡联合机构，属于国营性质企业。第三方支付机构POS机是由中国人民银行批准成立的具有第三方支付牌照的民营企业所属产品。
二、 POS机受理银行卡区别。目前中国银联POS机能够受理全国所有带有银联标志的银行卡消费业务，包括中、农、工、建、交五大国有银行，民生、光大、华夏等100多家银联成员单位。第三方支付机构现在虽然也号称所有银联卡都能刷，但是在第三方支付机构的收单合作银行中数量多是40多家，足见其与银联POS机的区别。
三、 POS机安装机构区别。银联POS机的安装机构主要由中国银联商务有限公司在各省的分支机构受理。第三方支付机构目前经过中国人民银行审批通过，且市场上多见的品牌主要有优乐通，通兑支付，华银支付，通联，汇付天下、付临门、盛付通、易宝支付、快钱支付、手机在线支付等等。第三方支付机构的POS机安装主要是通过市场推广的方式。市场推广的方式主要是在各省市招代理商。各代理商取得代理资格的主要方式是向第三方缴纳一定数额的保证金和代理费。每个第三方的加盟费和代理费不尽相同，一般在20-50万之间。在取得代理资格之后，在其代理区域其往往通过再次向下级地市或地方招收二级代理，然后二级代理招收三级代理……
四、 POS机布放费用的区别。银联POS机属于中国银联旗下，国内所有收单银行均属于中国银联或作单位，其POS业务旨在方便不同银行之间银行卡的交易，因此银联POS机安装过程中不收取商户任何费用，只收取机具押金，一般在500元左右；当机具商户不再使用的时候，通知布放机构收回POS机，并全额退回押金，且不收取折旧费。第三放支付机构的POS机来源主要是从厂家购买。再以原价或高价通过代理商布放其POS机。因为代理商在取得代理资格的同时交纳了大额的保证金和代理费，要想尽快收回资本，便在POS机布放的同时高价向商户收取费用，按照费率的不同，收取费用也不尽相同。一般0.5%的机具收取2000-3000元之间。1%的费率在1500-2500之间，封顶机具在3000-5000之间，且机具在不使用之后，机具和费用大多不予退还。其利润之大可以想象。
五、POS机消费费率区别。国内市场上所有POS机安装费率，按照中国人民银行的要求，均要采用银联标准。银联商务在安装POS机的过程中自然是严格执行自己制定的规定，不然如何能够让全国的成员单位满意。按要求，第三方支付机构必须也要按照银联标准执行，但是要知道他们要盈利就必须大量在市场布放机具，靠收取机具安装费用和刷卡分润来获利，在保证获利的同时还要同银联等同行业竞争，因此第三方所布放的机具中， 0.5%费率商户占有相当大的份额。在银联执行标准中，只有大型超市，家电卖场等与民生相关的商户才可办理0.5%费率机具。
六、 POS机风险控制的区别。国内所有的POS收单企业都受中国人民银行的直接监管，银联和第三方支付机构也不例外。另外第三方支付机构还受当地银联分公司的直接监管。每家POS收单企业也都有自己的风险控制系统。相对来讲，银联因为市场存在时间长，经验丰富，所以风险控制比第三方支付要更为成熟和稳定。银联POS机要求所有的商户银行卡收单账户必须为商铺对公账户，这就降低了资金风险。而第三方支付机构的银行卡收单账户可以为法人的个人账户，虽方便了商户现金的使用，但是资金存在一定风险。
七、 POS机到账渠道区别。银联POS机在持卡人消费之后，资金到达商户账户的时间为第二个工作日。资金在消费至到达商户账户期间，银联不参与资金的流转，只是对资金流转数据通过系统做出处理。第三方支付机构POS机现在大部分都是在持卡人消费之后第二个工作日到账，但是持卡人消费资金首先到达第三方支付机构的账户，然后第三方在通过自己的系统，按照POS机的费率扣除手续费之后再转入到商户账户里面。现在市场上也存在有部分第三方支付机构的POS机能够当天到账或即时到账。
八、 POS机申请标准的区别。银联POS机申请标准要求商户必须要有实体商铺，且对该商户进行实地考察，拍摄商铺照片，取得商铺营业执照，税务登记证，对公账户账号，法人有效身份证件等。第三方支付机构POS机申请标准大部分与银联的标准类似。少数第三方商户申请提供资料只需要营业执照和法人有效证件即可办理。
以上是我对现在市场上存在的各种POS机办理商区别的大致概述。现在第三方安装的POS机有不少商户不良使用，中国人民银行不可能对全国所有的商户全面监管，造成有不法分子有可乘之机，希望我们的文章能够对需要的人有所帮助。